Přírodní památka v údolí Vazoveckého potoka, který vyvěrá z 25 m dlouhé otevřené jeskyně. Nejdokonalejší seudokrasový systém v České republice.
(Přírodní rezervace) Rybník s přilehlým mokřadem a vlhkou loukou. V přilehlé lipové doubravě rostou nejmohutnější duby letní z celé CHKO. Severozápadní břeh je upraven jako písečná pláž a přináší radost rekreantům v autokempu.
Pod hradem Kost na návsi je první v řadě na Klenici. Přibírá ještě potok z Partotického rybníku a pokračuje komorovými sádkami ve Střehomi a rybníkem Buškovským. Pod ním je Šlejferna a největší rybník Červenský u Dolního Bousova.
Leží u hradu Kost směrem na Turnov a je typický svou tmavou barvu. Dávají mu ji prameny, vytékající z koberců rašeliníků.
Rašelinové jezírko (umělého původu) na jz. svahu Tábora poblíž Lomnice nad Popelkou. Výskyt řady chráněných a vzácných druhů vodních a bahenních rostlin.
Pod Prachovskými skalami, asi 5 km od Jičína. Skupina tří rybníků (Oborský, Němeček, Vražda), největší je Oborský rybník, na jehož jižní straně je tábořiště a autokemp.
(Národní přírodní památka) Klokočka je částí nivy potoka Bělá při železniční trati ve Velkém Rečkově. Nalezneme zde ukázku glaciálně reliktní tajgové mokřadní vegetace a jednu ze dvou lokalit popelivky sibiřské v České republice. Zvířena je zastoupena především členovci, měkkýši a obojživelníky, převážnou část chráněného území pokrývá vrbová olšina mokřadní.
Dva krásně položené rybníky, mezi nimiž se rozprostírají čisté jehličnaté lesy s pískovcovými skalkami. V obou rybnících je příjemné koupání a jsou u nich kempy. Jsou ideálními základnami pro výlety do oblasti kolem vrchu Mužský, tedy na Valečov, Drábské světničky, Příhrazské skalní město, ale i na Kost.
Člověk začal výrazně měnit tvář zdejší krajiny před 6000–7000 lety. Mezi největší zásahy do přirozené krajiny patří i regulace vodního režimu. Prakticky všechny vodní toky v Českém ráji , včetně Libuňky, byly aspoň zčásti upraveny člověkem. Její původní charakter nejlépe dokládá tento úsek mezi Ktovou a Borkem. Proto byl 22. 4. 1998 vyhlášen za přírodní památku. Vidíme zde přirozený tok v hlubokém korytu s ukázkovými meandry a zachovalými břehovými porosty.
Přírodní rezervace byla vyhlášena v roce 1999 a je vedle Hruboskalska a Příhrazských skal největší rezervací chráněné oblasti Český ráj. Zajišťuje územní ochranu především mokřádům na dně údolí kolem Želejovského potoka a Žehrovky.
Prokopské údolí - Malebné údolí od hradu Kost k Libošovicům.
(Národní přírodní památka) Část nivy potoka Rokytky nedaleko Nové Vsi. Vyskytuje se zde vzácný postglaciální relikt popelivky sibiřské v charakteristických společenstvech (slatinná a podmáčená olšina).
Směřující od hradu Kost kolem rybníku Obora či Na pile k obci Střehom (zachovalý vodní mlýn). V Plakánku je i několik pískovcových lomů, z nichž byl odebírán kámen na stavbu hradu Kosti (těsně u staveniště) i soboteckého kostela (nad rybníkem Obora), jiný byl i ve veseckém Plakánku.
Údolí Jizery a Galerie - Přírodní rezervace (125 ha, vyhl. r. 1951), kaňonovité údolí se smíšenými lesními porosty a geologicky cenným útvarem. Pro pěší návštěvníky je území zpřístupněno Riegrovou stezkou, vedoucí po pravém břehu Jizery ze Semil do Železného Brodu. Stezka je zčásti vylámaná ve skále a vede také po železné visuté galerii (80 m dlouhé). Technickou zajímavostí je na levém břehu Jizery železniční trať, procházející sérií tunelů o celkové délce 743 m, a na pravém břehu Jizery 1300 m dlouhý tunel, přivádějící od jezu na Jizeře vodu k elektrárně pod Spálovem.
S unikátním skalním břehem patří vedle Rokytňáku, Vidláku, Krčáku, Dolského, Nebáku a Podsemínského rybníka k osmi dochovaným rybníkům V podtroseckých údolích. Skalní věže vystupují přímo z hladiny rybníka. Písčité dno a teplá voda láká v létě ke koupání.
Rybník, který je v údolí pod bývalým hradem Kozlovem dobře skryt před světským ruchem, zabezpečuje základní životní podmínky především pro zvláště chráněné a ohrožené druhy mokřadních rostlin a živočichů s vazbou na louku a rybník.
Jako největší rybník chráněné krajinné oblasti Český ráj byl vyhlášen přírodní rezervací 22. 4. 1998 (80,5 ha). Rybník je od svého založení (v 16. stol.) využíván především k chovu ryb, ale má i své hodnoty přírodovědné. Doposud zde byly zjištěny celkem 183 druhy ptáků.
Potok (26 km) pramenící v záp. části Prachovských skal a po 24 km s překonáváním asi 130 km výškového rozdílu přivádí do Jizery vodu ze 100km2 Českého ráje. Po všech stránkách je údolí Žehrovky jedním z přírodně nejcennějších území celého kraje. Je až neuvěřitelné, že nenápadný tok Žehrovky kdysi roztáčel soukolí osmi mlýnů.